北京市公安局设有办公室、指挥部（区域警务合作办公室）、政治部、警务督察总队（维护民警执法权益办公室）、审计处、警务保障部、经济犯罪侦查总队、治安管理总队、内部单位保卫局、刑事侦查总队、出入境管理总队（出入境管理局）、反恐怖和特警总队、网络安全保卫总队（情报信息中心、北京市网络与信息安全信息通报中心）、监所管理总队、人口管理和基层工作总队、警务航空总队（北京市人民政府航空队、北京市航空应急救援队）、公安交通管理局（交通警察总队）、法制总队、公共交通安全保卫总队（公共交通安全保卫分局）、环境食品药品和旅游安全保卫总队、禁毒总队等内设机构，天安门地区分局、清河分局、森林公安分局等直属分局，东城分局、西城分局、朝阳分局、海淀分局、丰台分局、石景山分局、门头沟分局、房山分局、通州分局、顺义分局、昌平分局、大兴分局、怀柔分局、平谷分局、密云分局、延庆分局等属地分局，以及北京警察学院、北京市禁毒科技中心等事业单位，分别承担有关业务工作。