北京市公安局设有政治部、审计处、情报指挥中心（区域警务合作办公室）、办公室（警务管理和国际合作总队）、警务科技支援总队、警务督察总队（维护民警执法权益办公室）、经济犯罪侦查总队、治安管理总队、内部单位保卫总队（内部单位保卫局）、刑事侦查总队、出入境管理总队（出入境管理局）、反恐怖和特警总队、网络安全保卫总队（北京市网络与信息安全信息通报中心）、监所管理总队、人口管理和基层工作总队、警务航空总队（北京市人民政府航空队、北京市航空应急救援队）、交通管理总队（交通管理局）、法制总队、公共交通安全保卫总队（公共交通安全保卫局）、环境资源和食品药品犯罪侦查总队（知识产权犯罪侦查总队）、禁毒总队、无人机安全防控总队等内设机构，天安门地区分局、清河分局、森林公安分局等直属机构，东城分局、西城分局、朝阳分局、海淀分局、丰台分局、石景山分局、门头沟分局、房山分局、通州分局、顺义分局、昌平分局、大兴分局、怀柔分局、平谷分局、密云分局、延庆分局等派出机构，以及北京警察学院、北京市禁毒科技中心等事业单位，分别承担有关业务工作。